大不列颠联合王国的建议是脓肿抽吸或引流后药物治疗4~6周，如果脓肿未行引流，则需治疗6~8周。一项回顾性研究发现，平均抗菌治疗时间为62天。当临床好转，且神经影像上有实质性的改善时，才可以考虑终止药物治疗。
CT扫描在监测脓肿转归意义重大，随着时间的延长，脓肿的个数和大小逐渐缩小。我们不建议使用MRI来随访脓肿的大小，因为异常信号通常会持续数月。脓肿处的强化可以持续好几个月的时间。这种发现不足以作为手术探查的指征。
外科治疗
一旦脓肿的诊断确立，需要联系神经外科医师。在抗生素治疗之前，进行针刺抽吸和外科切除都可以被用作脓肿的治疗，同样也能明确诊断。唯一的例外是当存在菌血症的时候，此时可以利用血液培养来选择抗生素。和脓肿引流相比，外科切除较少复发。
总结
●脑脓肿成功的治疗通常需要抗菌和外科引流相联合。
●我们建议对所有可能的脑脓肿患者实施经验性的抗微生物治疗(Grade1B)。抗菌疗法(Antimicrobialtherapy)应当尽可能早的给予，尽管应当在抽吸明确诊断之后进行。经验性的抗菌治疗方案要依据推断出来的脓肿的来源和可利用的革兰氏染色结果。
●当培养结果发现了病原学证据时，我们建议治疗应当简化并针对那个病原体而展开(Grade1B)。
●我们建议治疗至少持续8周，根据临床经过和CT检查结果的明显改善作为评估依据(Grade1B)。
●我们建议当明显的占位效应出现时，或精神状态明显降低时可以使用(Grade2C)。
●脑脓肿的死亡率在0~30%。
●神经系统的后遗症中，癫痫发作最常见，见于30~60%的患者。
