1、没有完全治愈：新型冠状病毒感染，是指体内感染了新型冠状病毒，一般新型冠状病毒核酸检测结果为阴性，说明就已经痊愈了。但患者体内的病毒含量减少后，可能在进行新型冠状病毒核酸检测时，无法检测出，导致检测结果为假阴性，这种情况下患者并没有完全治愈，所以还是会出现头疼的情况。

2、睡眠不足：患者在感染新型冠状病毒后，可能会出现浑身疼痛、发热、头疼等不适症状，会影响到睡眠质量。如果患者睡眠不足，可能导致患者出现浑身无力、疼痛等不适症状，也可能出现头痛的情况。患者多休息，保证充足的睡眠即可缓解。

3、上呼吸道感染：患者感染新型冠状病毒后，身体的免疫力会有所下降，如果痊愈后没有做好身体的保暖工作，或者防护工作，可能会着凉，上呼吸道容易被细菌、病毒等病原体感染。可能导致患者出现头痛、精神不振等现象，患者应该遵医嘱服用、感冒灵颗粒、风寒感冒颗粒等治疗感冒的药物缓解不适。

除了上述的原因外，还可能是再次感染新型冠状病毒引起的。如果出现上述症状，患者需要及时前往进行新型冠状病毒核酸检测、血常规检查，患者在恢复期间，多休息，多喝水，清淡饮食，避免抽烟喝酒，可以加快身体恢复的速度。